Czyszczenie to podstawowy etap konserwacji szafek na dokumenty, a metody różnią się w zależności od materiału. W przypadku metalowych szafek na dokumenty użyj miękkiej, suchej szmatki, aby wytrzeć kurz z powierzchni. W przypadku zabrudzeń zwilż miękką szmatkę rozcieńczonym, łagodnym, neutralnym detergentem i delikatnie wytrzyj; unikaj kwaśnych, zasadowych lub żrących środków czyszczących, ponieważ mogą one uszkodzić wykończenie. Po czyszczeniu wytrzyj wilgoć suchą szmatką, aby zapobiec rdzy spowodowanej resztkami wody.
Czyszczenie drewnianych szafek na dokumenty wymaga szczególnej uwagi i kontroli wilgoci. W celu rutynowego czyszczenia należy przetrzeć powierzchnię lekko zwilżoną miękką ściereczką i natychmiast wytrzeć ją do sucha suchą szmatką. Unikaj przedostawania się nadmiernej wilgoci do drewna, co może spowodować wypaczenie lub pękanie. W przypadku fornirowanych lub lakierowanych drewnianych szafek nie należy używać past-na bazie wosku, ponieważ mogą one pozostawić lepką powierzchnię lub uszkodzić wykończenie.
Do czyszczenia szafek na dokumenty ze szklanymi drzwiami używaj dedykowanego środka do czyszczenia szkła i unikaj twardych narzędzi, które mogłyby porysować szklaną powierzchnię. Z drzwiami należy obchodzić się delikatnie podczas otwierania i zamykania, aby zapobiec pęknięciu szyby w wyniku uderzenia.